Seven Bridges (Velsera) se complace en anunciar el lanzamiento de la aplicación brillante OmicCircos R en la plataforma Cancer Genomics Cloud (CGC). La aplicación OmicCircos ha sido desarrollada en colaboración con el laboratorio Dr. Daoud Meerzaman en el NCI, desarrolladores del paquete R Bioconductor OmicCircos.
La aplicación R shiny permite a los investigadores generar diagramas circulares de alta calidad para visualizar variaciones en datos ómicos multidimensionales. Los datos pueden ser valores basados en la posición del gen o del cromosoma a partir de análisis de mutación, número de copias, expresión y metilación. Dado que esta aplicación no necesita ejecutarse desde Data Studio, es especialmente útil para los investigadores que tienen poca o ninguna experiencia en programación y, por lo tanto, no se sienten cómodos usando el paquete de bioconductores R.
Esta aplicación es capaz de mostrar variaciones en diagramas de dispersión, líneas y etiquetas de texto. Las relaciones entre las características genómicas se pueden presentar en forma de polígonos y curvas. Al utilizar las funciones estadísticas y gráficas en el entorno R/Bioconductor, OmicCircos también puede dibujar diagramas de caja, histogramas y mapas de calor a partir de múltiples datos de muestra. Cada pista se dibuja de forma independiente, lo que permite al usuario optimizar la pista de forma rápida y sencilla.
Para utilizar la aplicación OmicCircos en la plataforma CGC, siga los pasos detallados aquí: https://docs.cancergenomicscloud.org/docs/omiccircos
Divya San
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