Su selectividad de clientes y relaciones con intermedios de plegamiento tardío sugieren que GRP94 realiza funciones únicas de acompañante en la sala de emergencias

Su selectividad de clientes y relaciones con intermedios de plegamiento tardío sugieren que GRP94 realiza funciones únicas de acompañante en la sala de emergencias. GRP94 es una ATPasa cuya unión a nucleótidos está definitivamente mediada por el NTD, pero cuya actividad hidrolítica requiere la acción cooperativa del enlazador y los dominios medios. Abrir en una ventana separada Fig. 1 Características estructurales de GRP94. (A) Una mirada a la superficie molecular del dímero GRP94 (acceso PDB 2O1V). El sitio web amino-terminal (NTD) es definitivamente de color rojizo, el sitio web del enlazador (LD) – negro, el sitio web central (MD) – azul y el sitio web del terminal carboxi (CTD) C verde. Los dominios relacionados en el monómero opuesto están coloreados en tonos más claros. Se indican el sitio de unión del péptido en el NTD, el bucle catalítico (naranja) en el MD requerido para la hidrólisis de ATP y la hélice anfipática 21 (púrpura) en el CTD. Helix 21 se proyecta en una gran hendidura intradímera, justo encima de la superficie hidrofóbica que media la dimerización de la proteína. (B) Vista superficial del NTD vinculado a ADP (acceso PDB 1TC6). El NTD con este aspecto definitivamente se gira con respecto a A para visualizar el bolsillo de unión de nucleótidos (ADP) y la tapa (verde claro). (C) La conformación similar a una silla de GRP94 en respuesta, con un monómero en verde y el adicional en marrón. Adaptado, con permiso, de [10]. La conformación de GRP94 se ha investigado ampliamente en relación con su ciclo de ATPasa. La proteína cristaliza dentro de una conformación en V retorcida con ATP o ADP. [8]pero en respuesta asume un espectro de conformaciones muy parecidas a las de sus homólogos HSP90 y HSC82 [10]. La gran mayoría de las moléculas tienen una conformación extendida similar a una silla (Fig. 1C). Una segunda población menor está en una conformación menos prolongada cuya orientación CTD/NTD es similar a la observada en la estructura cristalina GRP94. [8]. Sin embargo, una tercera población rara es definitivamente aún más cerrada, una conformación que se muestra a partir de las conocidas construcciones de cristal GRP94ADP/AMP-PNP. [9, 11]. La adición de nucleótidos cambia el equilibrio hacia los estados más cerrados, pero la conformación prolongada sigue siendo la más común. [10]. Esta conformación prolongada es definitivamente más activa que otras en un ensayo de chaperonas. [12], quizás porque permite una mayor superficie de conexión con las proteínas cliente. El NTD alberga la mayoría de las actividades de unión de la proteína C. Se une a los péptidos a través de una lámina curva. Esmolol. [13](Fig. 1), al menos dos receptores únicos en las células dendríticas [14-16]nucleótidos y dos inhibidores de molécula pequeña, geldanamicina y radicicol [17]. Experimentos de cocristalización y competencia bioquímica. [8, 9, 11, 17, 18] muestre los inhibidores y los nucleótidos que se unen al mismo bolsillo, en la cara opuesta del sitio de unión del péptido (Fig. 1). La unión de geldanamicina, radicicol o sus derivados ofrece importantes efectos funcionales: esmolol cuando ocupan el sitio de unión de nucleótidos, la actividad de GRP94 hacia los clientes definitivamente se ve afectada [19, 20] y GRP94 definitivamente se convierte a una conformación más compacta [21, 22]. La capacidad de geldanamicina y radicicol para inhibir GRP94 es definitivamente importante desde el punto de vista médico, ya que se utilizan en el tratamiento de tumores malignos. Sin embargo, debido a que son inhibidores de pan-HSP90, estos medicamentos inhiben no solo a los clientes de HSP90 como las quinasas y los factores de transcripción, sino también al NCR1 conjunto de clientes GRP94. Por otro lado, el análogo de nucleótido NECA se une específicamente a GRP94, porque el acceso al sitio de unión de nucleótidos es definitivamente único del de HSP90 adicionales. [22]. Esto demuestra que los compuestos específicos de GRP94 se pueden encontrar o diseñar y, por lo tanto, se pueden usar para inhibir específicamente a los consumidores de GRP94. Si bien el bolsillo de unión de nucleótidos de GRP94 es Esmolol definitivamente altamente homólogo al de HSP90, su actividad hidrolítica ha sido controvertida. Al principio, se pensó que GRP94 se unía, pero no hidrolizaba ATP [23]. Sin embargo, reciente.