Resumen de la industria del descubrimiento de fármacos con Barry Bunin — 4 de enero de 2023

Barry Bunin, PhD Fundador y director ejecutivo Descubrimiento colaborativo de fármacos

Dr. Barry Bunin
Fundador y jefe ejecutivo
Descubrimiento colaborativo de fármacos

IA + Aprendizaje automático = Punto de inflexión para biofarmacia. Ese es el 2023 pronóstico de Farmacia feroz, lo que apunta a una avalancha de productos de inteligencia artificial y aprendizaje automático. El artículo describe las nuevas ofertas de varias empresas que buscan «revolucionar» el descubrimiento de fármacos con algoritmos y enfoques de IA y ML, como las tecnologías de pacientes en un chip. El artículo afirma: “Forzar la revolución es el costo exorbitante de I+D dado el tiempo típico necesario para desarrollar una terapia (12 a 18 años) y la tasa de fracaso (90%). Las herramientas de IA pueden reducir significativamente ambos”. El artículo cita al CEO de Quris, Isaac Bentwich, diciendo: “Son tres revoluciones las que están culminando ahora, al estilo de Hollywood. Es una tormenta perfecta: los órganos en un chip alcanzan la mayoría de edad, la IA se vuelve poderosa y se enfoca en este problema y el regulador dice que los estudios con animales apestan”. En CDD, siempre nos hemos centrado en manejar los datos de bioactividad, estructura química y secuencia biológica de manera correcta y elegante; los modelos dados son tan buenos o malos como los datos accesibles a múltiples cerebros con la experiencia en el dominio para apreciar el alcance y las limitaciones de la Interpretación de datos.

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¿Por casualidad hablas de proteínas? Hay un chatbot que podría. El periodico de Wall Street lleva un artículo titulado “Cómo la IA que impulsa los chatbots y las consultas de búsqueda podría descubrir nuevos medicamentos”. La premisa es que los algoritmos de procesamiento de lenguaje natural como los que se utilizan en las búsquedas de Google y ChatGPT de OpenAI prometen reducir el tiempo necesario para llevar los medicamentos al mercado. El artículo dice, en parte: “Los algoritmos de lenguaje natural, que analizan rápidamente el lenguaje y predicen el siguiente paso en una conversación, también se pueden aplicar a estos datos biológicos para crear modelos de proteínas y lenguaje. Los modelos codifican lo que podría llamarse la gramática de las proteínas, las reglas que gobiernan qué combinaciones de aminoácidos producen propiedades terapéuticas específicas, para predecir las secuencias de letras que podrían convertirse en la base de nuevas moléculas de fármacos. Como resultado, el tiempo requerido para las primeras etapas del descubrimiento de fármacos podría reducirse de años a meses”. Al igual que con el artículo anterior, el desafío fundamental es administrar de manera óptima los datos, sobre los cuales se pueden construir (m) cualquier modelo.

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De “Criatura de la Laguna Negra” a Algae Microbots. Los pensamientos de la película de terror de 1954 «La criatura de la laguna negra» de alguna manera me vinieron a la mente cuando leí este reciente titular en Noticias de descubrimiento de drogas «Los microrobots de algas combaten las infecciones bacterianas persistentes». Los bioingenieros están encontrando un papel heroico para las algas, utilizándolas para crear robots como camiones de reparto de antibióticos para proporcionar una entrega de medicamentos más eficiente. El artículo cita a Liangfang Zhang, bioingeniero de la Universidad de California en San Diego y coautor del estudio publicado en Materiales de la naturaleza. «Hubo muchas lluvias de ideas y debates para llegar a la idea de los robots de algas». El grupo de Zhang aterrizó en células de algas por varias razones. Un sistema de entrega de microrobot necesitaría ser lo suficientemente grande para transportar una dosis de medicamento, pero lo suficientemente pequeño para penetrar profundamente en los tejidos. Eligieron trabajar con Chlamydomonas reinhardtii, una especie de alga que mide unos 10 micrómetros de largo. La historia se vuelve aún más fascinante, y suena un poco a ciencia ficción, con la descripción de lo que hizo que los robots de algas fueran tan eficientes para administrar antibióticos a los pulmones de un ratón: “Los antibióticos tradicionales flotan pasivamente y difunden medicamentos de manera desigual a través de los tejidos. Las algas zigzagueaban y zigzagueaban, esquivando las células inmunitarias que las perseguían lentamente. Esto significaba que la droga llegaba a todos los rincones del pulmón. La natación persistente valió la pena; los microrobots requirieron una dosis de antibióticos 3000 veces menor para eliminar la infección que una transfusión intravenosa de los mismos antibióticos contra las mismas bacterias”. Zigzaguear para esquivar las células inmunitarias lentas…

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¿Las grandes farmacéuticas terminarán siendo dueñas de cannabis? Ese es el temor expresado en un reciente ensayo invitado en Los New York Times titulado “No se trata solo de marihuana. Toda nuestra política de drogas necesita una revisión”. El escritor señala que el presidente Biden firmó recientemente una ley para aliviar las restricciones onerosas sobre la investigación de la marihuana, y se alienta que el presidente haya ordenado al Departamento de Salud y Servicios Humanos y al fiscal general que revisen el estado de clasificación del cannabis. “Este proceso legal podría conducir a una regulación federal de las ventas para uso recreativo o una ley nacional que requiera receta médica para la marihuana”. El autor está a favor de reducir la marihuana de su estado actual como sustancia peligrosa de la Lista 1, a la par de la heroína, pero teme que la reclasificación en las categorías actuales siga siendo demasiado restrictiva. Ella escribe: “El cambio, sin embargo, es complicado. La reprogramación de la marihuana podría alterar las regulaciones estatales al imponer requisitos de prescripción. Esto podría dar cannabis a Big Pharma, que es la única industria con capacidad para fabricar y vender medicamentos regulados por la Administración de Drogas y Alimentos”.

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Barry A. Bunin, PhD, es el fundador y director ejecutivo de Collaborative Drug Discovery, que proporciona un enfoque moderno a la informática de investigación de descubrimiento de fármacos en la que confían a nivel mundial miles de investigadores líderes. CDD Vault es una base de datos biológica y química alojada que administra de forma segura sus datos privados y externos.

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