Pruebas de COVID-19 a nivel comunitario: la PCR digital es una herramienta clave

Este mes marcó el aniversario de la declaración del brote de SARS-CoV-2 como pandemia por parte de la Organización Mundial de la Salud. Prácticamente todos los aspectos de la vida normal y los negocios se vieron interrumpidos rápidamente por el nuevo y mortal coronavirus a medida que se extendía por todo el mundo. Pero los investigadores y las empresas de instrumentación analítica que los suministran estuvieron a la altura de las circunstancias.

Entre los mayores desafíos que enfrentaron los epidemiólogos y los gobiernos de todos los niveles fue medir con precisión la prevalencia de COVID-19 para rastrear la transmisión de la enfermedad dentro de las comunidades. Esta fue información vital para el esfuerzo estratégico para combatir la propagación del virus, incluso si los enfoques regionales variaron drásticamente. Pero incluso en las comunidades donde las pruebas basadas en PCR para la infección por COVID-19 estaban más disponibles, la naturaleza asintomática de una gran parte de los casos dificultó determinar con precisión las tasas de infección. Para comprender mejor la prevalencia de la enfermedad, algunos gobiernos y epidemiólogos buscaron pistas en una fuente comunitaria: las aguas residuales. Cuando las pruebas directas de la población no fueron posibles o poco prácticas, la vigilancia de las aguas residuales podría proporcionar mediciones indirectas, pero bastante precisas, de la propagación de COVID-19.

Hay varios métodos de prueba disponibles para cuantificar el ARN del SARS-CoV-2 presente en las aguas residuales. Los Centros para el Control de Enfermedades han publicado pautas para la vigilancia de aguas residuales en los EE. UU., recomendando el uso de PCR cuantitativa de transcripción inversa (RT-qPCR) o PCR digital de gotitas de transcripción inversa (RT-ddPCR), un método específico dentro de la PCR digital ( dPCR). RT-ddPCR se ha convertido en el método preferido, ya que ofrece varias ventajas sobre RT-qPCR. Si bien ambos métodos son sensibles al ARN de baja abundancia, la RT-ddPCR ofrece una mayor sensibilidad y, al mismo tiempo, facilita la cuantificación absoluta de los ácidos nucleicos, a diferencia de las mediciones de abundancia relativa que se logran con la RT-qPCR. La ddPCR también es menos sensible a la presencia de inhibidores que pueden influir en la reacción de amplificación. Además, un estudio publicado recientemente ha demostrado que la RT-ddPCR es capaz de cuantificar con precisión la carga viral del SARS-CoV-2 a partir del lisado crudo, lo que elimina la necesidad de extraer el ácido nucleico antes del análisis.

Las pruebas de aguas residuales fueron un impulsor inesperado de la demanda de dPCR

Las pruebas de aguas residuales fueron un impulsor inesperado de la demanda de dPCR en 2020, lo que convirtió a dPCR en una de las pocas tecnologías no diagnósticas que experimentó un fuerte crecimiento en un año marcado por graves interrupciones. Incluso cuando la respuesta global a la pandemia se aleja del diagnóstico y el monitoreo para centrarse en la vacunación masiva de la población, la vigilancia de las aguas residuales seguirá siendo importante, ya que la aparición de variantes del SARS-CoV-2 resistentes a la vacuna es una posibilidad grave. La demanda de los esfuerzos continuos de monitoreo impulsará la recuperación de la demanda de la investigación y el desarrollo no relacionados con COVID-19.

El mercado de PCR digital se examina en el recientemente publicado Informe de Evaluación Global de SDi 2021, que analiza de manera integral la dPCR en el contexto del mercado más amplio de PCR para proporcionar datos sobre el tamaño del mercado, la participación de los proveedores y las previsiones por tipo de producto, región, mercado final y aplicación. Junto con PCR, el informe examina 83 tecnologías de equipos e instrumentación individuales, organizadas en 10 categorías principales, lo que convierte al Informe de evaluación global en la herramienta de referencia definitiva para la industria de instrumentación analítica y de ciencias de la vida.

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