OpenHelix para exhibir en TRICON

Además, para los tipos de desarrolladores: ofrecen una forma de interactuar con el software Aquaria para agregar sus propias funciones de interés con su API. Tal vez tenga nuevas mutaciones que haya encontrado en alguna secuencia que haya obtenido en su laboratorio, por ejemplo. Están ofreciendo orientación sobre eso aquí: http://bit.ly/aquaria-features. Tocan esto en el video más largo (~ 27 min) si quieres una explicación un poco más. Sospecho que por el soporte de alta calidad que ofrecen, les interesará saber de usted y qué características le gustaría ver aplicadas a estas proteínas también.

Así que felicitaciones a este equipo por una herramienta ingeniosa y esfuerzos de divulgación multimedia realmente serios. Creo que estuvo bien hecho en todos los aspectos. Apuesto a que Reddit llegó a más personas adecuadas de lo que lo hará un comunicado de prensa. Los PIO toman nota: pongan a sus científicos en Reddit.

OpenHelix exhibirá en la Tri-Conferencia Internacional de Medicina Molecular (MMTC o TRICON) en el stand 129, del 16 al 18 de febrero. Mientras esté en el lugar de la Tri-Conference, lo invitamos a probar OpenHelix y no solo aprenderá cómo permitir una investigación más efectiva, sino que también recibirá una tarjeta de regalo de Starbucks por completar la demostración.

La 22ª Tri-Conferencia Internacional de Medicina Molecular es el evento preeminente de la industria sobre medicina molecular y se centra en el descubrimiento de fármacos, la genómica, el diagnóstico y la tecnología de la información. Con una duración de seis días este año, la Tri-Conference incluye un programa ampliado que incluye 6 simposios, más de 20 cursos breves y 17 programas de conferencias.

OpenHelix proporciona más de 100 conjuntos de tutoriales sobre herramientas bioinformáticas y genómicas populares y potentes. Cada conjunto de tutoriales incluye tutoriales de 30 a 60 minutos que destacan y explican las características y la funcionalidad necesarias para comenzar a usar un recurso de manera efectiva. Los conjuntos de tutoriales también incluyen diapositivas de PowerPoint, folletos y ejercicios para ahorrar tiempo y dinero al enseñar a otros.

Una suscripción de OpenHelix a los tutoriales permite una investigación más rápida y efectiva en su institución mediante un uso más eficiente de las herramientas disponibles públicamente para acceder a datos biológicos. Únase a algunas de las mejores universidades, instituciones de investigación y empresas de biotecnología para capacitar a los científicos sobre cómo usar estas herramientas críticas.

Para programar su demostración de 5 minutos del sitio OpenHelix y los conjuntos de tutoriales (y recibir una tarjeta de regalo de Starbuck), envíe un correo electrónico a Scott Lathe o llame al (425) 442-0322. Estaremos en el stand 129 en el Tri-Conference Exhibit Hall.

El consejo de la semana de esta semana es sobre Géminis, que es el acrónimo de «GENome MINing». A diferencia de la mayoría de los consejos que damos cada semana, este es un paquete de software. Pero sí usa y se integra con muchas bases de datos de Internet como dbSNP, ENCODE, UCSC, ClinVar y KEGG. También es una herramienta de código abierto disponible gratuitamente y un paquete de software bastante útil que brinda al investigador la capacidad de crear consultas bastante complejas basadas en genotipos, patrones de herencia, etc. El clip de 12 minutos anterior es una charla dada en una conferencia que da una introducción de la ciencia detrás de la herramienta.

Las modernas tecnologías de secuenciación de ADN permiten a los genetistas identificar rápidamente la variación genética entre muchos genomas humanos. Sin embargo, aislar la minoría de las variantes subyacentes a la enfermedad sigue siendo un desafío importante, aunque formidable, para la genética médica. Hemos desarrollado GEMINI (GEnome MINIng), un paquete de software flexible para explorar todas las formas de variación genética humana. A diferencia de las herramientas existentes, GEMINI integra la variación genética con un conjunto diverso y adaptable de anotaciones del genoma (p. ej., dbSNP, ENCODE, UCSC, ClinVar, KEGG) en una base de datos unificada para facilitar la interpretación y exploración de datos. Mientras que otros métodos proporcionan un conjunto inflexible de filtros de variantes o métodos de priorización, GEMINI permite a los investigadores redactar consultas complejas basadas en genotipos de muestra, patrones de herencia y anotaciones de genoma preinstaladas y personalizadas. GEMINI también proporciona métodos para consultas ad hoc y exploración de datos, una interfaz de programación simple para análisis personalizados que aprovechan la base de datos subyacente y herramientas gráficas y de línea de comandos para análisis comunes. Demostramos la utilidad de GEMINI para explorar la variación en genomas personales y estudios genéticos basados ​​en familias, e ilustramos su capacidad para escalar estudios que involucran miles de muestras humanas. GEMINI está diseñado para la reproducibilidad y la flexibilidad y nuestro objetivo es proporcionar a los investigadores un marco estándar para la genómica médica.

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