¡Esta es una nueva aplicación RShiny en Cancer Genomics Cloud (CGC) que agiliza la forma en que un usuario de CGC puede enviar sus datos a dbGAP! La aplicación dbGaP Submission Form Suite permite a un usuario importar, mapear y preparar fácilmente sus datos para importarlos a la base de datos de genotipos y fenotipos (dbGaP). Los usuarios pueden exportar fácilmente los metadatos de un proyecto de CGC a esta herramienta y luego transformarlos mediante la interfaz de usuario para que coincidan con el formulario de envío de dbGAP. Una vez que se transforman los datos, todo lo que queda es descargar el archivo de Excel y subirlo a dbGAP.
Para acceder a la aplicación dbGaP Submission Form Suite en el CGC, siga los pasos a continuación:
- Inicie sesión en el CGC.
- Cree o abra un proyecto que desee utilizar para la manipulación de datos con la aplicación. Si aún no tiene los datos en un proyecto en el CGC, puede cargarlos de antemano. Tenga en cuenta que los datos no tienen que estar en el mismo proyecto desde el que inicia la aplicación.
- Haga clic en la pestaña Navegadores interactivos. Se muestran las aplicaciones interactivas disponibles.
- Desplácese hacia abajo hasta la sección Aplicaciones interactivas personalizadas para encontrar la tarjeta de la aplicación de envío dbGaP.
- En la tarjeta de la aplicación de envío dbGaP, haga clic en Abrir. La aplicación se abre en una nueva pestaña.
- Haga clic en Sí para permitir que la aplicación acceda a sus recursos de CGC. Se muestra la pantalla de inicio de la aplicación y ahora puede comenzar a cargar datos.
Para obtener más información, siga nuestro guía detallada.
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Biran Lassiter
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