CONSEJO DE VIDEO DE LA SEMANA: INFORMACIÓN DE ESTRUCTURA DE PROTEÍNAS PARA ALCANCE PÚBLICO. DE VERDAD.

El consejo de esta semana no se trata de una herramienta específica, sino de una mirada realmente interesante sobre cómo se usó una herramienta en el contexto de algunos mensajes de divulgación pública general. Recientemente publiqué sobre Aquaria, una nueva herramienta disponible para que los biólogos exploren estructuras, mutaciones y dominios de proteínas de manera fácil de usar. Pero un ejemplo interesante de cómo se puede usar la información sobre las estructuras de las proteínas para impulsar la comprensión provino de una animación en video de la acumulación de proteínas en la enfermedad de Alzheimer. Solo echa un vistazo al video primero y disfrútalo. ¿Qué tan genial es esa canasta de clatrina que tira de la vesícula?

Me enteré mientras miraba las próximas charlas de VIZBI y exploraba su sitio en busca de otras funciones. En la sección de VizbiPlus hay una serie de excelentes animaciones de procesos moleculares, y este video fue uno de ellos. Asegúrese de estar atento a otros tweets con el hashtag #vizbi durante los próximos días. Apuesto a que verá algunas herramientas y visualizaciones asombrosas, como siempre.

Recientemente mencioné el video más largo y completo del equipo de Aquaria, pero no lo usé como consejo, solo usé la descripción general de la versión corta. Pero la versión más larga tenía esta pieza extra adicional de cómo este animador había utilizado su software. Aquí está Christopher Hammang, creador de este video, describiendo cómo usó la información de Aquaria para generar el modelo estructural para su animación:

A menudo, ayuda a las personas ver cómo alguien más usó una herramienta para un proyecto para comprenderlo mejor. Y este parecía un ejemplo tan convincente e inusual que quería resaltarlo.

Así que, de nuevo, le indicaré la información sobre herramientas de Aquaria de principios de este mes para explorar más, ahora con una comprensión de un ejemplo de su uso. Pero también le animo a que eche un vistazo a las otras animaciones que salen de VIZBI en la página de VizbiPlus. Lo juro, el intestino animado es mucho más genial de lo que cabría esperar. Los videos de diabetes + receptor de insulina son realmente informativos y útiles. Un video de cáncer ilustra un p53 que se porta mal. Ve a mirar.

Community y lo encuentro muy útil. A menudo surgen preguntas y respuestas en Biostars que están relacionadas con nuestros lectores (usuarios finales de los recursos de genómica). Todos los jueves destacaremos uno de esos elementos o discusiones aquí en este hilo. Puede hacer preguntas en este hilo, o siempre puede unirse a Biostars.

Biostars es un sitio para preguntar, responder y discutir preguntas y problemas de bioinformática. Somos miembros del mundo.

De hecho, muchas personas en todo el mundo están trabajando en este dominio. algunos estudiaron bioinformática y otros no (incluso veo que los médicos están haciendo bioinformática). He estado leyendo artículos de todas las revistas conocidas que publican artículos de bioinformática relacionados con la biología o bioinformática pura. Puedo decir, más o menos en torno a un tema todo el tiempo. Sé que es una pregunta muy general y no podemos dar una gran y directa respuesta. Sin embargo, me gustaría saber qué temas cree que son el tema de moda en estos días para la bioinformática.

por ejemplo, mucha gente está haciendo secuenciación (por supuesto que no podemos tener un estándar de oro porque “todos los modelos están mal pero algunos son útiles”), ¿entonces este tipo de estudios van a ser para siempre?

Todos sabemos que la bioinformática es solo una herramienta y no la ciencia pura en sí. Entonces, ¿podemos pensar que es un campo muerto ya que las matemáticas/estadísticas ya se encontraron o queda mucho por hacer? si queda tanto por hacer, ¿cuáles podrían ser esos temas?

tengo muchas ganas de saber tu opinion

Fuente del artículo

Deja un comentario