Primer problema de bioinformática en una serie errática de longitud indeterminada

Periódicamente en mi trabajo o mientras escribo este blog me encuentro con problemas computacionales que tienen el aspecto de hacer, al menos en mi mente, muy buenos problemas de enseñanza. Algunas de las características son que el problema básico es relativamente simple de explicar, las habilidades requeridas son reutilizables en otros problemas, los conceptos son afines a otros problemas y que el problema planteado se puede expandir en pasos a algo mucho más rico. Tales problemas podrían incluso ser el núcleo de proyectos de bioinformática de pregrado o incluso de escuela secundaria, aunque con las noticias recientes de un estudiante de secundaria secuenciando el genoma de su pez ángel muerto ¡la barra para los proyectos de la escuela secundaria ha subido un poco! A diferencia de un problema de programación que no se ajusta a estos, voy a etiquetar publicaciones como «Mejor que FizzBuzz».

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¿Qué conversación le gustaría tener a cada proveedor de instrumentos de secuenciación?

En la telenovela Hombres Locos, una máxima favorita del personaje principal Donald Draper es «si no te gusta lo que dice la gente, cambia la conversación». Hay una gran parte de verdad en esto: la forma en que pensamos sobre cualquier tema se ve fuertemente afectada por la forma en que se enmarca el tema: cambie el encuadre y, a menudo, la conversación cambia radicalmente. ¿En qué podría querer cada proveedor de secuenciación que centremos nuestras conversaciones, especialmente con la presentación de la serie Illumina NovaSeq X la semana pasada?

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