¡AGBT 2023 está casi sobre nosotros!

AGBT está a menos de una semana en Hollywood, Florida, y he dejado que todo lo demás se adelante antes de escribir cualquier cosa aquí. La Conferencia de JP Morgan a principios de este mes no tuvo grandes fuegos artificiales de los proveedores de secuenciación, pero sí algunas noticias.

Quizás el mayor impacto es el programa de precios de Element Biosciences que permite genomas humanos de $ 200 (costo de reactivo). Es un plan de descuento por volumen y aparentemente requeriría tres AVITI para lograrlo, pero quizás la parte más interesante es que no requiere un gran compromiso: si sus compras de reactivos por un cuarto están por encima del umbral, entonces obtiene el precio de ganga. eso da como resultado $200/genoma. Si el próximo trimestre te tomas un respiro, no te quedes encerrado en una costosa orden permanente. Parece que Element también traerá lecturas cortas más bien largas, un modo 2×300, para competir con las versiones más largas de Illumina. Hay algunos nichos que aman este formato. Element también ha publicado datos que muestran que las inserciones de 1 kilobase funcionan a la perfección en AVITI y afirma que esto puede suponer una mejora significativa en las llamadas de variantes al tener un extremo anclado más sólidamente en una secuencia única.

MGI ha anunciado que venderá secuenciadores en los EE. UU. bajo la marca Complete Genomics. Con cuatro secuenciadores en su línea, que van desde el portátil E25 hasta el monstruoso T7, Complete tiene como objetivo vender a cualquier usuario.

Singular Genomics parece estar todavía atascado en los problemas de la cadena de suministro de componentes de instrumentos; será interesante escuchar una actualización de ellos en la reunión.

Illumina ha recibido muchos pedidos de NovaSeq X. Los detalles sobre la química de Infinity todavía parecen ser escasos; tal vez la atmósfera relajada junto a la piscina pueda liberar alguna información a la naturaleza.

PacBio ha vendido 76 de Revios a partir de JPM; eso es alrededor del equivalente a 900 cajas de Sequel IIe en términos de rendimiento bruto. También anunciaron un programa de asociación “PacBio Compatible” para construir un instrumento de soporte, flujo de trabajo, informática y ecosistema de reactivos. Espere escuchar más sobre la plataforma de lectura corta Onso, que, según PacBio, tiene una precisión espectacular.

Oxford Nanopore no participa oficialmente en JP Morgan o AGBT, pero habrá muchos usuarios allí y más de unas pocas charlas de plataforma y carteles que utilizan la tecnología.

Ultima será uno a tener en cuenta: no es un patrocinador importante, pero también ha aparecido recientemente en algunas preimpresiones interesantes.

Hay muchas charlas interesantes en la agenda, lo que lleva al dilema siempre presente de si programar reuniones privadas o escuchar las grandes presentaciones científicas. Como ha sido la tendencia, la reunión está muy centrada en el ser humano, aunque hay varias charlas sobre vigilancia viral y una sesión completa sobre genómica de vertebrados no humanos. Las conversaciones sobre nuevas tecnologías parecen ser pocas y distantes entre sí, fuera de las sesiones de los principales patrocinadores.

Espero volver a conectarme con muchos viejos amigos y hacer muchos nuevos. Esté atento al tipo con una gorra de béisbol (probablemente mi Yellowstone NP) y anteojos. Y como siempre, los consejos y sugerencias son bienvenidos en los comentarios, mensajes directos de Twitter o por correo electrónico.