9 herramientas para la exploración interactiva de datos de RNAseq de una sola célula

por

1. gen celular https://github.com/chanzuckerberg/cellxgene

2. bodega https://github.com/euxhenh/cellar

3. scSVA: una herramienta interactiva para la visualización y exploración de big data en ómica unicelular https://www.biorxiv.org/content/10.1101/512582v1

4. ASAP: una plataforma basada en la web para el análisis y la visualización interactiva de datos de RNA-seq de una sola célula https://academic.oup.com/bioinformatics/article/33/19/3123/3852081?login=false

5. [iSEE](https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/iSEE.html) Proporciona funciones para crear una interfaz gráfica de usuario interactiva basada en Shiny para explorar datos almacenados en objetos SummarizedExperiment, incluidos metadatos a nivel de fila y columna.

6. [VISION](https://github.com/YosefLab/VISION) Un módulo imparcial y de alto rendimiento para interpretar datos de scRNA-seq.

7. [DISCO](http://inmunesinglecell.org/): Integración profunda de ómicas unicelulares. ¿Quiere visualizar millones de celdas en línea y anotar el tipo de celda automáticamente? ¡¡¡Intentalo!!! ¡Haga que la celda única sea más fácil y haga la vida más fácil!

8. [TISCH](http://tisch.comp-genomics.org/) Tumor Immune Single-cell Hub (TISCH) es una base de datos de scRNA-seq que se centra en el microambiente tumoral (TME).

9. [CancerSCEM](https://ngdc.cncb.ac.cn/cancerscem) Hasta la fecha, la versión 1.0 de CancerSCE consta de 208 muestras de cáncer en 28 estudios y 20 tipos de cáncer en humanos

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